五轴加工中心刀具不管是多少刃的立铣刀，首先要将刀刃端面垂直于轴线磨平，这是保证五轴加工中心刀刃卓越点能够处在同一平面的关键。五轴加工刀具磨刀前，需要对砂轮进行检查，如果发现有砂轮跳动、圆柱面不规则、圆角过大等情况，就需要进行修整。
一般可用砂轮修正器（金刚石修整器、齿片修整器等）对砂轮的圆柱面进行修整，亦可用磨粒硬度相对较大的废旧砂轮进行修整。如果砂轮侧平面已经不平整，即可更换砂轮片。
首先，分别刃磨每一个刃的时候以每一刃的尖为基准，以保留刃尖为原则，修磨前角（没有崩刃可以不磨）、后角、副后角（如果是大切削量需要较好的强度，建议修磨刀前面加大刀刃楔角）及刃倾角。
其次，有关角度的选择是后角6°～8°、（副后角30°～45°）刃倾角1°～3°。后角的选择是要根据工件的硬度而改变的，材料硬度大则角度就小些；刃倾角的角度选择原则是4个刃都必须向中间凹进去，角度愈平则粗糙度精度就愈好。这时加工深度愈深（如大于2mm但要在许可范围），粗糙度精度反而会更好，原因是整条切削刃都参与了切削的结果。
然后，五轴联动加工刀具的刃磨完成后，在一个五轴加工中心平台上将铣刀立起，如果轴线垂直，所有的刃尖都能平齐，刀刃的偏角都能对中均匀，这样的五轴CNC加工刀具就能够符合要求。
另外，五轴加工机床刀具也可以借助在一平板上用90°直角尺校正，放平后观察铣刀与直角尺之间是否有间隙或间隙是否均匀。一般先观察两个相对较高的脚（先触底的两个脚），如果不垂直就修磨较高的脚，磨致两个对面脚一样高（即垂直）。
这时这两个脚与另外两个对面的脚出现了高度差，铣刀就会摆动，再将两个较高的脚同时磨低。同样，再将铣刀旋转90°观察另外两个对面脚的垂直度，使4个脚同时触底并使铣刀垂直。
五轴加工中心在手工刃磨中，刀刃的高低及各角度都不容易把握，在训练时要因人而异，只要注意磨出一点后角就可以了。顶部刃不平时只要让刀尖卓越即可，另外如果不是加工内腔清角的情况，还可以把刀尖处修磨大于0.2mm的倒角，以增加刀尖强度。
